As preocupaes de segurana do WeTransfer levam ao uso de um tnel criptografado para cada arquivo compartilhado para aumentar a segurana dos arquivos. Os arquivos so carregados nos servidores da empresa por meio de uma conexo segura Transport Layer Security (TLS). Uma vez armazenados, os arquivos passam por uma camada adicional de criptografia usando Advanced Encryption Standard (AES)-256.